Después de cinco años guardando en secreto sus sentimientos, el estudiante de secundaria Taiju Ooki finalmente está listo para confesarle su amor a Yuzuriha Ogawa. Sin embargo, justo cuando comienza su declaración, una cegadora luz verde envuelve la Tierra y petrifica a toda la humanidad—convirtiendo a cada ser humano en piedra.Varios milenios después, Taiju despierta y descubre que el mundo moderno ha desaparecido por completo, y que la naturaleza ha reclamado la Tierra durante todos esos años de silencio humano. Entre un mundo de estatuas de piedra, Taiju encuentra a otro ser humano con vida: su amigo amante de la ciencia, Senkuu, quien ha estado despierto durante algunos meses. Taiju se entera de que Senkuu ha ideado un gran plan: revivir por completo la civilización mediante la ciencia. La fuerza bruta de Taiju y la inteligencia de Senkuu se combinan para formar una poderosa alianza, y pronto descubren un método para revivir a los petrificados.Sin embargo, el ambicioso plan de Senkuu se ve amenazado cuando sus ideales son cuestionados por otros que también despiertan. Mientras tanto, la causa detrás de la petrificación de la humanidad sigue siendo un misterio.