Tras el final de las Guerras de Piedra, los antiguos miembros del Imperio del Poder de Tsukasa unen fuerzas con el Reino de la Ciencia para construir un barco capaz de surcar el océano en busca de respuestas sobre el misterio de la petrificación global. Sin embargo, antes de que puedan iniciar su viaje, Senku y sus amigos deben encontrar algunos recursos importantes y superar algunos nuevos avances científicos para construir el tipo de barco que necesitan.